中国药科大学图书馆历史悠久，专业特色鲜明，是国内药学文献信息中心。每个校区都有一座图书馆，位于各校区教学中心区。其中玄武门校区图书馆为四层框架结构，成“日”字形，面积6000余平方米，呈欧式建筑风格。江宁校区3万平方米的新馆已在规划设计之中，江宁校区启用的是临时图书馆，位于教学楼的A区，面积3千平方米。