空军总医院创建于1956年10月，50多年来，在总部首长，空军和空后党委、首长、机关的高度重视和亲切关怀下，在兄弟单位的大力支持和热情帮助下，医院牢记“姓军”为兵宗旨，恪守“精益求精、满腔热忱”服务理念，努力建设以人文型、科技型、智能型、法制型、绿色医院为基本框架的现代化医院。医院1993年被世界卫生组织评定为“国际爱婴医院”，1994年被总后卫生部评定为“三级甲等医院”，1996年、1998年先后被国家卫生部、总后卫生部确定为全国、全军临床药理基地。